PILI lahir sebagai PILI NGO Movement, sebuah ruang yang mempertemukan organisasi, pegiat konservasi, dan pemerhati lingkungan untuk berbagi informasi, pengetahuan, serta membangun kolaborasi dalam upaya pelestarian alam Indonesia.

Pada masa awal, PILI mengembangkan dua inisiatif utama, Spreading Knowledge dan Shelter Initiative, melalui penyebaran informasi konservasi, publikasi, diskusi, serta penguatan jejaring antarorganisasi. Salah satu tonggaknya adalah penerbitan Indonesian Conservation Newsletter (INCL) yang menjadi media berbagi informasi konservasi bagi berbagai kalangan.

PILI NGO Movement bertransformasi menjadi Yayasan Pusat Informasi Lingkungan Indonesia (PILI Green Network). Transformasi ini memperluas peran organisasi dari sebuah gerakan jejaring menjadi lembaga yang mampu mengembangkan program konservasi, penguatan kapasitas, dan kemitraan secara lebih luas.

PILI mulai memperluas kolaborasi dengan pemerintah, organisasi masyarakat sipil, akademisi, dan berbagai mitra pembangunan. Pada fase ini, organisasi mengembangkan fungsi Communication & Information serta Partnership & Education sebagai fondasi dalam membangun jejaring konservasi di Indonesia.

PILI berkembang menjadi organisasi yang tidak hanya menyebarkan pengetahuan, tetapi juga mendampingi masyarakat dan melaksanakan berbagai program di lapangan. Pendekatan Spreading Knowledge dan Shelter Initiative diwujudkan melalui konservasi keanekaragaman hayati, restorasi ekosistem, pemberdayaan masyarakat, penelitian, serta pengembangan pengelolaan sumber daya alam yang berkelanjutan.

Memasuki babak baru, PILI mengusung identitas Bridging Sustainability dengan visi "Terwujudnya pengelolaan sumber daya alam yang adil di Indonesia." Fokus organisasi diarahkan pada peningkatan kualitas kemitraan strategis, penguatan kapasitas para pihak, dan pengembangan inovasi untuk memperbaiki rantai pasok produk berbasis komunitas.